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１３２人目の素数さん
数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス
分からない問題はここに書いてね459
【R言語】統計解析フリーソフトＲ 第6章【GNU R】 [無断転載禁止]©2ch.net

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数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス
205 ：１３２人目の素数さん[sage]：2020/04/04(土) 11:37:34.81 ID:ZFu90Xbq
SEIR MODEL

dS(t)/dt = mu*(N-S) - b*S(t)*I(t)/N - nu*S(t)
dE(t)/dt = b*S(t)I(t)/N - (mu+sig)*E(t)
dI(t)/dt = sig*E(t) - (mu+g)*I(t)
dR(t)/dt = g*I(t) - mu*R + nu*S(t)
mu:自然死亡率 b:感染率(S->I)
nu:ワクチン有効率(S->R) sig:発症率(E->I),g:回復率(I->R)

の微分方程式の数値解を使ってシミュレーション

対策しない（外出を控えず、マスクもしない）方が患者や死者は増えるけど早く収束するな。
contacｔ_rate と　trannsmission_probabilityを変化させてグラフにしてみた。

https://i.imgur.com/6OgJkDb.png
分からない問題はここに書いてね459
37 ：１３２人目の素数さん[sage]：2020/04/04(土) 16:30:28.75 ID:ZFu90Xbq
>>26
1-(1-10/150)^3
=0.186962962963
分からない問題はここに書いてね459
40 ：１３２人目の素数さん[sage]：2020/04/04(土) 19:11:42.72 ID:ZFu90Xbq
>>37
非復元だからこれは誤答
【R言語】統計解析フリーソフトＲ 第6章【GNU R】 [無断転載禁止]©2ch.net
806 ：１３２人目の素数さん[sage]：2020/04/04(土) 21:44:33.98 ID:ZFu90Xbq
>>804
DF=rbind(
c(0,0.05,0.1,0.15),
c(0,0,0.05,0.05),
c(0.15,0.1,0.05,0.1),
c(0,0.05,0.2,0.05),
c(0.1,0.15,0.1,0.05),
c(0.15,0.05,0.1,0.05),
c(0.0001,0.0001,0.0001,0.0001))

とダミーに0.0001を加えても
> DF2ICC1(DF)
ICC(1,1) ICC(1,k)
0.2462707 0.5665262

> psych::ICC(DF)
type ICC F df1 df2 p lower bound
Single_raters_absolute ICC1 0.25 2.3 6 21 0.072 -0.027
Single_random_raters ICC2 0.25 2.3 6 18 0.079 -0.028
Single_fixed_raters ICC3 0.25 2.3 6 18 0.079 -0.034
Average_raters_absolute ICC1k 0.57 2.3 6 21 0.072 -0.115
Average_random_raters ICC2k 0.57 2.3 6 18 0.079 -0.122
Average_fixed_raters ICC3k 0.57 2.3 6 18 0.079 -0.154

となるから、高値データでなくてもいいみたい。


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